自耦变压器的结构与普通双绕组变压器不同，普通双绕组变压器的一、二次绕组都是单独分开的，绕组之间只有磁的联系，没有电的联系。而自耦变压器的二次绕组就是一次绕组的一部分，一、二次绕组之间不仅有磁的联系，还有电的联系。从一次绕组到二次绕组的功率传递，仅有小部分是由电磁感应作用传递，而更大部分是由电路直接传导的。自耦变压器可看作是由普通变压器演变而来，低压绕组可看作是高压绕组的一部分。
与普通双绕组变压器的区别：
(1)电压关系。自耦变压器空载运行时，如果忽略漏抗压降不计，加在自耦变压器上的电压均匀地分布于一次绕组的各匝间，一、二次绕组的电压关系与普通双绕组变压器的电压关系相同。
(2)电流关系。自耦变压器二次绕组接上负载运行时，如果忽略励磁电流不计，一、二次绕组的电流关系与普通双绕组变压器的电流关系相同。
(3)容量关系。普通双绕组变压器的容量从一次绕组传递到二次绕组侧，全部靠电磁感应传递，额定容量与绕组容量相等。而在自耦变压器中，额定容量与绕组容量不同，额定容量决定于总的输出功率，绕组容量却决定于需由电磁感应作用传递的那部分功率，绕组容量与额定容量之比为
。变压器传向负载的功率可分为两部分：
1)一部分功率是绕组的电磁功率，它是通过电磁感应传递过去的。
2)一部分功率是绕组的传导功率，它是通过电的联系传递过去的，传导功率是不需要增加绕组容量的。