由于短路接地故障、一、二次回路操作、雷击及高能辐射等原因，在变电站的二次回路上将会产生电磁干扰，使接在二次回路上的继电保护装置误动作或遭受损坏。干扰电压可通过交流电压及电流测量回路、控制回路、信号回路、直接辐射等多种途径。
二次回路受到的干扰主要有50Hz干扰、高频干扰、雷电干扰、控制回路的干扰及高能辐射设备的干扰等。
(1) 50Hz干扰。当变电站内发生高压接地故障，有故障电流流人地网时，位于地网上不同两点间将会产生电位差，其最大值可达每千安故障电流10V (10V/kA)。
(2)高频干扰。当变电站高压开关设备操作或系统故障时，会在二次回路上引起高频干扰。
(3)雷电干扰。当发生雷击时，由于电及磁的耦合，将在导线与地之间感生干扰电压。
(4)控制回路的干扰。当断开接触器或继电器的线圈时，会产生宽频谱，其干扰可达50MHz。
(5)高能辐射设备的干扰。由于近处步话机工作，也可能会产生高频电磁场干扰。